Для Joomla! 2.x и выше:
Заходим в админку и выбраем пункт "Расширения" - "Менеджер плагинов". Находим плагин "Редактор - TinyMCE" и открываем его настройки. Находим блок "Запрещенные теги" и удаляем оттуда "script".
Для Joomla! 1.x:
Заходим в админку и выбраем пункт "Расширения" - "Менеджер плагинов". Находим плагин "Редактор - TinyMCE" и открываем его настройки. Находим пункт "Очищать код" и ставим переключатель на пункт "Нет".
*Либо рекомендую пользоваться плагином "Редактор - CodeMirror" или "Редактор - Без редактора" и в таком режиме можно вставлять любой код. Но есть один минус в таком подходе: Если вы откроете такой материал с помощью "TinyMCE", то он удалит запрещенные теги.