Можете не обращать внимания на эти сообщения phpMyAdmin. Точно не скажу, но в PMA (phpMyAdmin) есть дополнительные функции, которые позволяют делать связи между таблицами, я еще ни разу не видел, что б их кто-то использовал.
Второе говорит о том, что у вас сессия закончится через 1440 секунд неактивности (так в php указано по умолчанию), а не так как хочет phpMyAdmin. Тут уже кроется криворукость разработчиков PMA. Лучше бы вместо сообщения указывали session.save_path и тогда бы этот вопрос совсем не возникал. это как говориться читали документацию по PHP, но не дочитали.